La PCR-RFLP, por sus siglas en ingles de Polymerase Chain Reaction - Restriction Fragment Length Polymorphism, es una técnica que radica en el corte con endonucleasas de restricción de los productos amplificados por PCR. Si dos amplicones presentan una variación de la secuencia nucleotídica, en los sitios de reconocimientos de las enzimas de restricción, generarán distintos patrones de fragmentos.